Pues mira... Lo que yo hacía era introducir el código maestro en la ventanita que se te abre cuando quieres meter los Gamesharks, después le das "Aceptar" y en seguida abría nuevamente la misma ventanita (antes de echar a andar el juego otra vez) y ponía el Gameshark que iba a usar; le das "Aceptar" otra vez y te deberían quedar los 5 Gamesharks tiqueados o seleccionados (Sí, sólo metiste 2 tgamesharks, pero es que el "Código maestro" tiene 3 series de códigos y el Gameshark que usas tiene 2, y por eso se ven 5 en la lista).
Cuando ya los tengas dale a "Aceptar" para que la ventana de los Gameshark se cierre y listo, deberían funcionarte.
Esto usando el emulador VBA 1.8 te lo aseguro, porque era el que yo usaba.
Te recomiendo que una vez que uses el Gameshark lo desactives, porque si vas activando muchos al mismo tiempo el juego se puede corromper y tu partida puede perderse.
No abuses de los Gamsesharks (en todos los juegos), porque a parte de quitarle la emoción al juego pueden deteriorarte el rom, y por lo general eso pasa.

Esop!! ^^

-xªºz-